云南省自然人税收管理系统扣缴客户端是适用于云南省的个人所得税系统扣缴新版客户端，由国家税务总局云南省税务局提供，用于扣缴义务人的个人所得税代扣代缴的申报，是云南省扣缴义务人的必备客户端。
《扣缴客户端》主要用于扣缴义务人为在职员工申报个人所得说。对应的申报表是《个人所得税基础信息表(A表)》和《扣缴个人所得税报告表》。
为了降低报表填写难度，《扣缴客户端》对报表填写做了拆分处理。申报的主体流程是：
开始——人员登记——报表填写——申报表报送——网上缴款——结束
在一个纳税年度内，员工如果没有及时将专项附加扣除信息报送给扣缴义务人，以致在扣缴义务人预扣预缴工资、薪金所得税时未享受扣除的，员工可以在次年3月1日至6月30日内，向汇缴地主管税务机关进行汇算清缴申报时办理扣除。
若纳税人的专项附加扣除信息发生变化，纳税人可通过“个人所得税”APP、“自然人办税服务平台”网页自行更新，通知扣缴义务人在扣缴客户端中点击【下载更新】，下载最新的专项附加扣除信息；或填写《个人所得税专项附加扣除信息表》提交给扣缴义务人。扣缴义务人在扣缴客户端中点击【修改】，更新填报信息。
软件介绍
扣缴客户端在任何一个专项附加扣除界面都可以导入全部人员的各项专项附加扣除信息。导入完成后，在该专项附加扣除页面只会显示本项专项附加扣除的人员信息，无此项扣除的人员不在此显示，可在其他专项附加扣除页面查看相应的专项附加扣除信息。
系统安装完成后，需要进行注册。注册的过程大致为通过纳税人识别号从税务系统获取相应的企业信息，保存到本地扣缴客户端的过程，具体为：
点击安装完成界面上的【立即体验】(或点击桌面“自然人税收管理系统扣缴客户端”快捷方式)，即进入注册流程。注册共有五步：第一步：录入单位信息;第二步：获取办税信息;第三步：备案办税人员信息;第四步：设置登录密码;第五步：设置数据自动备份。
常见问题
1、单位发2019年1月的工资，怎么在软件里面按新税制计算出应缴纳多少税款?
步骤一：打开扣缴客户端，录入并报送员工信息(对已经录入的，可忽略);
步骤二：可通过标准模版表采集员工专项附加扣除信息，导入扣缴客户端;也可以由员工自己通过“个人所得税”APP或自然人办税服务平台网页报送专项附加扣除信息(每项的申报方式要选定为“通过扣缴义务人申报”并选定给指定的单位)，三天后单位再点击【下载更新】按钮下载员工的专项附加扣除信息;
步骤三：导入当月收入正常工资薪金表，并点击【预填专项附加扣除】按钮，扣缴客户端会根据已有的专项附加扣除信息自动进行预填;
步骤四：点击【税款计算】步骤，系统会自动计算当月应纳税额，最后导出计算结果即可。
2、单位员工如果在2019年1月份没有采集专项附加扣除项目，3月份才开始采集，会存在多缴税的情况吗?
综合所得采用累计预扣法计税：
本期应预扣预缴税额=(累计预扣预缴应纳税所得额×税率-速算扣除数)-已预扣预缴税额
累计预扣预缴应纳税所得额=累计收入-累计免税收入-累计基本减除费用-累计专项扣除-累计专项附加扣除-累计依法确定的其他扣除
这种情况对于员工个人来说，在专项附加扣除采集前可能会多预缴税款，但在采集后每次申报时会累计扣除前几个月的总和，如果税款为负值的，暂不退税，一直往后留抵，在次年3-6月进行个人年度汇算清缴申报时多退少补。
